Say No to Schistosoma

[SuperVirus]

Say No to Schistosoma

Misión
La misión de la Di no al proyecto de Schistosoma es identificar a los posibles candidatos de fármacos que podrían ser desarrollados en los tratamientos para la esquistosomiasis. La gran potencia de cálculo de World Community Grid se utilizará para llevar a cabo simulaciones por ordenador de las interacciones entre los millones de compuestos químicos y ciertas proteínas diana. Esto le ayudará a encontrar los compuestos más prometedores que podrían conducir a tratamientos efectivos para la enfermedad.

Significado
La esquistosomiasis es una enfermedad tropical causada por parásitos que se transmiten por caracoles de agua dulce. La enfermedad mata a 200.000 personas cada año y afecta a más de 207 millones de personas. La esquistosomiasis es sólo superada por la malaria en su devastación socioeconómica. Investigadores de la Universidad Infórium en Belo Horizonte y Minas-FIOCRUZ, Brasil, está utilizando World Community Grid para buscar compuestos químicos que pueden llevar a nuevos fármacos para el tratamiento de la enfermedad.

Enfoque
Un programa de software llamado Viña del Instituto de Investigación Scripps en La Jolla, California, será utilizado para llevar a cabo los experimentos de química virtual. Estos experimentos virtuales búsqueda para encontrar cuál de millones de compuestos de la droga podría ser capaz de desactivar determinadas proteínas esenciales para la supervivencia del parásito. La detección de los compuestos de los mejores potenciales de los medicamentos es un primer paso en el proceso de desarrollo de tratamientos efectivos para la enfermedad. Con suficiente poder de cómputo, este examen se puede hacer mucho más rápidamente que el uso de experimentos de laboratorio convencionales. Equipos existentes a disposición de los investigadores requeriría aproximadamente 30 años para realizar la proyección. Sin embargo, se estima que la potencia de World Community Grid puede reducir el tiempo requerido para un año o menos. La información sobre los compuestos de los mejores candidatos será publicada por los científicos, y esta información estará disponible en el dominio público para que otros científicos se basan en sus investigaciones. El trabajo de laboratorio utilizando los mejores candidatos identificados por este proyecto podría conducir al desarrollo de mejores medicamentos para combatir la esquistosomiasis.

Sobre el Proyecto

La esquistosomiasis es una enfermedad tropical causada por gusanos parásitos, que mata a más de 200.000 personas al año y afecta a más de 207 millones de personas en 74 países. Hasta la fecha, no existen vacunas disponibles para prevenir la enfermedad, a pesar de una extensa investigación. La esquistosomiasis es sólo superada por la malaria en su devastación socioeconómica.

La enfermedad es causada por gusanos trematodos parásitos (del género Schistosoma). Las larvas del parásito, publicado por caracoles de agua dulce, penetran en la piel y, finalmente, viajan hasta el hígado a través del torrente sanguíneo. La alimentación en la sangre del huésped, los parásitos madurar y moverse a través de las venas de otras partes del cuerpo, tales como la vejiga y los intestinos. Durante su tiempo de vida, que puede ser décadas, se puede producir cientos de huevos por día. Algunos de los huevos son excretados en la orina o las heces, entonces eclosionan e infectar a más caracoles.

La respuesta inmune del organismo a los huevos, que permanecen en el cuerpo, es la principal causa de la enfermedad. La respuesta inmune es el mecanismo de defensa natural del cuerpo a los invasores extranjeros y por lo general causa inflamación temporal de los tejidos afectados. Sin embargo, la enfermedad causa inflamación continua, lo que daña los órganos afectados y por lo tanto el problema se vuelve más grave. La esquistosomiasis puede afectar a diversos órganos como el hígado, el bazo, el intestino y los riñones, y puede conducir a la muerte. Una de las especies de Schistosoma también puede causar cáncer de vejiga.

Antimonio, oxamniquina, Mirazid y metrifonato son fármacos que se han utilizado para tratar la esquistosomiasis, pero estos medicamentos son muy eficaces, o no, se han suspendido, o en el trabajo contra sólo ciertas formas de la enfermedad. Un medicamento administrado por vía oral llamado praziquantel es actualmente el mejor tratamiento para la esquistosomiasis. Sin embargo, existe evidencia de que Schistosoma pueden hacerse resistentes a prazicuantel. Por estas razones, existe una urgente necesidad de desarrollar nuevos tratamientos.

Para acelerar la búsqueda de fármacos potenciales contra la esquistosomiasis, la potencia de cómputo de World Community Grid se utilizará para la pantalla de millones de compuestos químicos como los posibles candidatos posibles de tratamiento de drogas. En lugar de realizar experimentos de laboratorio costosos y requerir mucho tiempo, las simulaciones de estos millones de experimentos se realizaron utilizando el software que se ejecuta en los equipos miembros de World Community Grid.

Un programa de software llamado Viña del Instituto de Investigación Scripps en La Jolla, California, será utilizado para llevar a cabo los experimentos de química virtual, más precisamente conocido como acoplamientos moleculares. De acoplamiento molecular es el proceso de determinar qué tan bien los dos compuestos químicos se unen entre sí. Uno de los compuestos químicos se designa como la diana, en este caso una de varias proteínas esenciales para la supervivencia del parásito. El otro compuesto es uno de una colección de millones de compuestos de varias bases de datos, la catalogación de los compuestos conocidos y su estructura atómica exacta. La posición de acoplamiento experimentos de los dos compuestos en todas las orientaciones posibles, calcular la energía de enlace para cada uno, que le dice lo bien que se pegan en esa configuración. Si un compuesto se une a la proteína diana, puede ser útil en desactivación de la función de esa proteína y por lo tanto el progreso de la enfermedad. Los investigadores están identificando proteínas Schistosoma que se utilizará para el proyecto y se determina la estructura atómica de estas proteínas para que puedan ser utilizados como objetivos para los experimentos de acoplamiento molecular.

Los cálculos VIÑA se utiliza para identificar los compuestos químicos más prometedores que pueden inhibir estas proteínas. Los cálculos que son muy intensivos y que tomaría más de 30 años para completar el uso de computadoras destinadas normalmente a los investigadores. World Community Grid será capaz de reducir el tiempo necesario para probar los millones de compuestos contra estas proteínas a un año o menos. La información sobre los compuestos de los mejores candidatos será publicada por los científicos, y esta información se colocará en el dominio público para que otros científicos se basan en sus investigaciones. El equipo de investigación planea llevar a cabo el trabajo de laboratorio adicional con los mejores candidatos identificados por los cálculos de Viña, lo que podría conducir al desarrollo de mejores fármacos para combatir la esquistosomiasis.

Aplicaciones para Windows, Mac y Linux. 100MB de RAM por unidad.

Mas información: Wikipedia y World Community Grid